本作是《Keroro军曹》系列第二部剧场版，延续TV动画的搞笑风格，同时加入更宏大的冒险主题。故事从Keroro小队日常的侵略计划失败开始，一颗神秘海之宝玉突然降临，引发巨大海啸，将小队卷入深海世界。在那里，他们遇到了自称“深海之王”的邪恶势力，其企图利用公主的力量统治海洋，并毁灭地表世界。为了阻止阴谋，Keroro军曹与队员们被迫放下内斗，联手人类朋友日向冬树、夏美，潜入海底王国。过程中，他们不仅要应对会说话的海洋生物、机关重重的海底迷宫，还要面对Keroro最怕的“水”元素挑战——笑料百出却危机四伏。而公主的真实身份与深海之王的过去，也隐藏着惊人的秘密。影片在搞笑之余，深刻探讨了环境保护与责任主题，通过深海生态的拟人化，传递“人类与自然共存”的讯息。最终决战中，Keroro小队为守护地球与海洋，展现出超越外星侵略者的真正勇气，公主也在众人帮助下觉醒，用爱与理解化解了千年仇恨。全片节奏紧凑，笑泪交织，既满足粉丝对角色互动的期待，也为新观众提供了完整且感人的故事体验。